快遞公司在處理丟失郵件時，需依據郵件是否保價來決定賠償方式。保價郵件若丟失或全部損毀，將按照保價額進行賠償；若部分損毀或內件短少，則按保價額與郵件實際價值的比例進行賠償。對于未保價的郵件，若丟失、損毀或內件短少，將按照實際損失賠償，但最高賠償額不超過所收取資費的三倍。若郵件為掛號信件，最高賠償額為所收取資費的三倍。
根據《中華人民共和國郵政法》第四十七條的規定，郵政企業在營業場所的告示中和給據郵件單據上，需以明顯方式載明賠償規定。若郵政企業因故意或重大過失導致郵件損失，或未履行上述義務，不得援用限制賠償責任的規定。
《快遞暫行條例》第二十七條規定，對保價快件，經營快遞業務的企業需按與寄件人約定的保價規則確定賠償責任；未保價快件，則根據民事法律有關規定確定賠償責任。國家鼓勵保險公司開發快件損失賠償責任險種，鼓勵快遞企業投保。
寄件人交寄快件和經營快遞業務的企業收寄快件時，應遵守《中華人民共和國郵政法》關于禁止或限制寄遞物品的規定。禁止寄遞物品的目錄及管理辦法由國務院郵政管理部門會同相關部門制定并公布。

在郵政服務中，若選擇保價郵寄，一旦郵件丟失或全部損毀，將按照保價金額進行賠償。若郵件僅部分損毀或短少，則會根據實際損失的價值進行賠償，但賠償金額不得超過保價金額。
如果保價郵件的價值超過郵章規定的最高保價限額，且發生部分損毀或短少的情況，且損毀或短少的價值不低于保價金額，那么仍會按照實際的保價金額進行賠償。
對于未保價的郵件，如果發生丟失、損毀或短少的情況，將按照實際損失進行賠償，但最高賠償金額不得超過所付郵費的二倍。此外，如果郵件丟失或全部損毀，已經收取的各項費用（除了保價費之外）將全部退還給客戶。
若因非客戶責任導致特快專遞郵件延誤（以對外公布的全程時限為標準），那么所收取的郵費將予以退還。

國內標準快遞和快遞包裹郵件賠償標準：
因承運人原因造成郵件丟失、短少、損毀或延誤的，按下列標準賠償：
1、 保價郵件發生丟失、完全損毀的，按保價金額賠償;部分損毀或短少的，按實際損失賠償，最高不超過保價金額，同時退還已收取的郵費。
2、未保價郵件發生丟失、損毀或短少的，按實際損失價值賠償，最高賠償金額不超過所付郵費的六倍，同時退還已收取的郵費。如該賠償標準不足以彌補損失，請根據寄遞物實際價值選擇等值保價服務。
3、郵件發生延誤的，國內標準快遞郵件以承運人對外公布的全程時限為標準，退還已收取的郵費;國內快遞包裹郵件以國家郵政局申訴判責時限為標準，退還已收取的郵費。
4、一票多件郵件的賠償按與寄件人簽訂的協議執行。
以下情況承運人不承擔賠償責任：
1、不可抗力(保價郵件除外)。
2、寄遞物品違反禁寄或限寄規定，被國家行政機關沒收或依照有關法律法規等處理的。
3、外包裝完好，而內件短少或損毀，簽收人簽收時未提出異議的。
4、 因寄件人、收件人過失或寄遞物品本身原因造成郵件損失或延誤的。
5、 因寄件人填寫本單不規范或填寫錯誤等，導致郵件延誤或退回的。
6、用戶自寄件之日起滿一年未查詢又未提出賠償要求的。
7、任何由于郵件的丟失、短少、損毀或延誤等原因造成的其他直接損失或間接損失。
8、 超過寄遞限額以上部分的損失。