農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)糾紛的原因有:1.土地承包權(quán)不清。土地流轉(zhuǎn)過程中農(nóng)戶間的糾紛可以歸舊結(jié)為承包權(quán)不清引起的經(jīng)濟(jì)糾紛。農(nóng)民缺乏維權(quán)意識和法律知識。在生活實(shí)踐中，大多數(shù)農(nóng)民不熟悉土地流轉(zhuǎn)的方式，大多采用口頭協(xié)議形式，缺乏必要的書面形式。3.行政干預(yù)、權(quán)力濫用侵蝕農(nóng)民利益。很多農(nóng)村土地糾紛產(chǎn)生是因?yàn)榇寮壗M織和政府職能部門的權(quán)力濫用，損害農(nóng)民利益。4.管理機(jī)制不健全。農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)糾紛的解決方法是:1.明晰產(chǎn)權(quán)，協(xié)調(diào)利益關(guān)系。明晰的產(chǎn)權(quán)關(guān)系和產(chǎn)權(quán)各項(xiàng)權(quán)能主體權(quán)利義務(wù)范圍的明確界定是實(shí)現(xiàn)農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)的必要前提。完善對被征地農(nóng)民的補(bǔ)償安置制度，健全最低生活保障體系。完善農(nóng)地非農(nóng)化過程中對被征地農(nóng)民的補(bǔ)償安置制度，制定合理可行的農(nóng)地補(bǔ)償標(biāo)準(zhǔn)。3.加強(qiáng)對失地農(nóng)民的就業(yè)培訓(xùn)，增強(qiáng)其再就業(yè)能力。4.進(jìn)行適當(dāng)?shù)木蜆I(yè)安置，穩(wěn)定承包關(guān)系。

法律依據(jù):
《中華人民共和國農(nóng)村土地承包法》 第三十七條 土地承包經(jīng)營權(quán)流轉(zhuǎn)，當(dāng)事人雙方應(yīng)當(dāng)簽訂書面合同。采取轉(zhuǎn)包、出租、互換或者其他方式流轉(zhuǎn)土地承包經(jīng)營權(quán)的，應(yīng)當(dāng)報(bào)發(fā)包方備案。