根據(jù)《刑事訴訟法》規(guī)定，公訴案件和自訴案件的區(qū)別主要有：
　　(一)案件來源不同。公訴案件是由國家公訴機關(guān)即人民檢察院提起的；而自訴案件是由被犯罪行為侵害的公民、個人或者他的法定代理人、監(jiān)護人、近親屬直接向人民法院提起的。
　　(二)犯罪性質(zhì)和危害程度不同。公訴案件中犯罪行為對社會的危害性也比較大，案件一經(jīng)起訴人民法院必須依法進行審判；而自訴案件犯罪行為對社會的危害性也比較小，因而，在自訴案件中，可以適用和解、調(diào)解、撤回自訴等制度。
　　(三)舉證責(zé)任不同。自訴案件的舉證責(zé)任規(guī)定為完全由自訴人承擔(dān)；而公訴案件，收集和核對案件事實和證據(jù)以及查獲犯罪嫌疑人是司法機關(guān)應(yīng)盡的職責(zé)。

刑事自訴與公訴的主要區(qū)別在于案件來源、犯罪性質(zhì)與危害程度、審查程序以及當(dāng)事人的訴訟權(quán)利與地位。首先，案件來源上，公訴案件由國家的公訴機關(guān)即人民檢察院提起，而自訴案件由被侵害的公民、個人或其法定代理人、監(jiān)護人、近親屬直接向人民法院提起。
其次，犯罪性質(zhì)與危害程度有所不同。公訴案件中犯罪行為性質(zhì)嚴重，對社會危害性大，一旦起訴，人民法院必須依法審判。自訴案件中犯罪行為性質(zhì)多不嚴重，對社會危害性較小，自訴人在判決前可以自行和解或撤訴。
再次，審查程序存在差異。公訴案件實行程序性審查，只要起訴書內(nèi)容明確，附有證據(jù)目錄、證人名單和主要證據(jù)復(fù)印件或照片，就應(yīng)決定開庭審判，審查主體是負責(zé)案件審理的審判組織成員。自訴案件則需經(jīng)過兩次審查，一次為立案前程序?qū)彶椋硪淮螢殚_庭前實體審查，審查主體不同。
當(dāng)事人的訴訟權(quán)利和地位也不同。在自訴案件中，被告及其法定代理人有權(quán)提起反訴，而公訴案件的被告不能對案件事實本身對司法人員提出反訴。自訴案件的被害人有獨立的上訴權(quán)，而公訴案件的被害人無獨立上訴權(quán)，只能請求人民檢察院在法定期限內(nèi)提起抗訴。此外，自訴案件中的被害人是自訴人，處于原告地位，而公訴案件中公訴機關(guān)（人民檢察院）為原告，被害人則為證人地位。
對于親告罪，若被害人自行提起控告，公安機關(guān)可以立案。我國法律對親告罪的規(guī)定，即只有被害人自行提起追究才能對侵權(quán)方進行處罰，這包括了侮辱罪、誹謗罪以及虐待罪等罪行。若被害人不希望提起訴訟，則無處罰必要。

刑事公訴和自訴是刑事訴訟中兩種不同的起訴方式，它們之間存在明顯的區(qū)別。刑事公訴是由檢察機關(guān)代表國家對犯罪嫌疑人提起公訴，而刑事自訴則是由被害人或其法定代理人直接向人民法院提起的訴訟。
一、刑事公訴
刑事公訴是指檢察機關(guān)在依法對刑事案件進行偵查后，認為犯罪嫌疑人的行為已經(jīng)構(gòu)成犯罪，應(yīng)當(dāng)追究刑事責(zé)任，于是代表國家向人民法院提起公訴的訴訟活動。在公訴案件中，檢察機關(guān)作為公訴機關(guān)，負責(zé)收集證據(jù)、審查起訴，并在法庭上支持公訴。被告人則需要在法庭上接受審判，并有權(quán)進行辯護。公訴案件通常涉及較為嚴重的犯罪行為，需要由國家機關(guān)進行追究和打擊。
二、刑事自訴
刑事自訴是指被害人或其法定代理人，在遭受犯罪行為侵害后，直接向人民法院提起刑事訴訟，要求追究犯罪嫌疑人的刑事責(zé)任。在自訴案件中，被害人或其法定代理人作為自訴人，需要自行收集證據(jù)、提起訴訟，并在法庭上進行陳述和辯護。自訴案件通常涉及一些輕微的刑事案件，如侮辱、誹謗、輕傷等，這些案件可能由于各種原因未能得到公訴機關(guān)的起訴，但被害人仍然可以通過自訴方式維護自己的合法權(quán)益。
三、區(qū)別比較
1、起訴主體不同：刑事公訴的起訴主體是檢察機關(guān)，代表國家行使公訴權(quán)；而刑事自訴的起訴主體是被害人或其法定代理人，以個人名義提起訴訟。
2、案件性質(zhì)不同：公訴案件通常涉及較為嚴重的犯罪行為，需要由國家機關(guān)進行追究和打擊；而自訴案件則多涉及一些輕微的刑事案件，被害人可以通過自訴方式維護自己的合法權(quán)益。
3、證據(jù)收集方式不同：在公訴案件中，檢察機關(guān)負責(zé)收集證據(jù)、審查起訴；而在自訴案件中，被害人或其法定代理人需要自行收集證據(jù)并提起訴訟。
綜上所述:刑事公訴和自訴在起訴主體、案件性質(zhì)和證據(jù)收集方式等方面存在明顯的區(qū)別。公訴案件由檢察機關(guān)代表國家提起公訴，涉及較為嚴重的犯罪行為；而自訴案件則由被害人或其法定代理人以個人名義提起，多涉及一些輕微的刑事案件。
法律依據(jù)：
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第一百七十條規(guī)定：
“人民檢察院對于監(jiān)察機關(guān)移送起訴的案件，依照本法和監(jiān)察法的有關(guān)規(guī)定進行審查。人民檢察院經(jīng)審查，認為需要補充核實的，應(yīng)當(dāng)退回監(jiān)察機關(guān)補充調(diào)查，必要時可以自行補充偵查。對于監(jiān)察機關(guān)移送起訴的已采取留置措施的案件，人民檢察院應(yīng)當(dāng)對犯罪嫌疑人先行拘留，留置措施自動解除。人民檢察院應(yīng)當(dāng)在拘留后的十日以內(nèi)作出是否逮捕、取保候?qū)徎蛘弑O(jiān)視居住的決定。在特殊情況下，決定的時間可以延長一日至四日。人民檢察院決定采取強制措施的期間不計入審查起訴期限。”
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第二百一十條規(guī)定：
“自訴案件包括下列案件：（一）告訴才處理的案件；（二）被害人有證據(jù)證明的輕微刑事案件；（三）被害人有證據(jù)證明對被告人侵犯自己人身、財產(chǎn)權(quán)利的行為應(yīng)當(dāng)依法追究刑事責(zé)任，而公安機關(guān)或者人民檢察院不予追究被告人刑事責(zé)任的案件。”