刑事案件申訴流程主要包含以下幾個步驟：
首先，刑事申訴的立案階段，司法機關會根據(jù)申訴權人的申訴要求進行受理。立案是對申訴權人申訴的正式確認，是申訴程序開始的重要標志。
其次，進入刑事申訴的審查階段，司法機關會對申訴所提出的問題進行調查和核實。這個階段的主要任務是審查申訴內容的合法性、真實性以及是否存在需要重新審判的合理理由。
審查結束后，司法機關將根據(jù)審查結果進行處理。如果申訴內容合理，確實存在需要重新審判的情形，司法機關將啟動重新審判程序。否則，申訴將被駁回，申訴權人的申訴權利將無法得到進一步的法律保障。
以上就是刑事案件申訴的主要流程，確保申訴程序的公正、合法，是維護司法公正、保護公民權益的重要手段。
法律依據(jù)：《刑事訴訟法》第二百四十二條，具體包括以下情形：
(一) 有新的證據(jù)證明原判決、裁定認定的事實確有錯誤，可能影響定罪量刑的。
(二) 據(jù)以定罪量刑的證據(jù)不確實、不充分、依法應當予以排除，或者證明案件事實的主要證據(jù)之間存在矛盾的。
(三) 原判決、裁定適用法律確有錯誤的。
(四) 違反法律規(guī)定的訴訟程序，可能影響公正審判的。
(五) 審判人員在審理該案件的時候，有貪污受賄，徇私舞弊，枉法裁判行為的。

刑事案件申訴得到立案，意味著受理單位認為該案審理或案情有可斟酌之處，可能重新審理該案。
刑事申訴應在被告人刑罰執(zhí)行完畢后二年內提出，但有特殊情況時也可受理。刑事申訴程序包括申訴立案和審查兩個階段，審查內容包括案件事實和適用法律的正確性。審查結果可能導致申訴被駁回或重新審判。對于再審改判無罪或免予處分的當事人，善后工作需由相關部門負責處理。
刑事申訴的立案，是指司法機關接受申訴權人申訴的法定訴訟形式。《暫行規(guī)定》的第6條規(guī)定：人民法院收到申訴后，均應登記，認真審閱。原審人民法院審查、處理刑事申訴，均應立卷。這就說明，申訴權人提出申訴時，人民法院或人民檢察院對屬于本院管轄的，都應采取文書形式立案。至于申訴立案得具備什么條件的問題，不應過于苛求。只要初步確認申訴人具備申訴主體資格，在法定期限內，具狀提出一定理由。管轄法院或人民檢察院即應予以立案審查。
綜上所述：刑事案件申訴被高院立案的后果可能包括以下方面：首先，被立案意味著申訴請求被高院認可，有機會重新審理案件。其次，被立案可能導致案件進一步延長審理時間，增加當事人的精神和經濟負擔。此外，被立案還意味著被告將面臨更嚴格的審查和調查，可能會受到更嚴厲的刑事處罰。同時，立案也為當事人提供了爭取自己權益的機會，可以通過法律程序進一步辯護和申訴。總之，刑事案件申訴被高院立案的后果是一個復雜的過程，其結果將取決于具體案件的事實和法律適用。
【法律依據(jù)】：
《中華人民共和國行政訴訟法（2017修正）》：
第五十一條
人民法院在接到起訴狀時對符合本法規(guī)定的起訴條件的，應當?shù)怯浟浮Ξ攬霾荒芘卸ㄊ欠穹媳痉ㄒ?guī)定的起訴條件的，應當接收起訴狀，出具注明收到日期的書面憑證，并在七日內決定是否立案。不符合起訴條件的，作出不予立案的裁定。裁定書應當載明不予立案的理由。原告對裁定不服的，可以提起上訴。起訴狀內容欠缺或者有其他錯誤的，應當給予指導和釋明，并一次性告知當事人需要補正的內容。不得未經指導和釋明即以起訴不符合條件為由不接收起訴狀。

刑事案件申訴期限為兩年。
申訴者可于刑罰執(zhí)行結束之日起兩年內向法院提交申請。
若逾越此期限，法院將不予受理，除非符合以下三種情形之一：
1、可能宣告原審被告無罪；
2、原審被告在此期間內向法院提出申訴且未獲受理；
3、涉及疑難、復雜或重大案件。
【法律依據(jù)】
《關于規(guī)范人民法院再審立案的若干意見》第十條，人民法院對刑事案件的申訴人在刑罰執(zhí)行完畢后兩年內提出的申訴，應當受理；超過兩年提出申訴，具有下列情形之一的，應當受理：
(一)可能對原審被告人宣告無罪的；
(二)原審被告人在本條規(guī)定的期限內向人民法院提出申訴，人民法院未受理的；
(三)屬于疑難、復雜、重大案件的。
不符合前款規(guī)定的，人民法院不予受理。