是的，屬于委托研發(fā)，并且你們擁有知識產(chǎn)權(quán)，軟件公司只是委托開發(fā)商，幫你技術(shù)開發(fā)而已。

研發(fā)支出！
具體成本根據(jù)軟件開發(fā)協(xié)議合同等，確定后更加項(xiàng)目預(yù)算，再通過財(cái)務(wù)會計(jì)核算，納入項(xiàng)目開發(fā)成本。
法律條文可根據(jù)采購法，合同法等。
具體扣除多少，這個(gè)各個(gè)公司不一樣的。

按什么開票？看你們是否符合四技收入（技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)）的確認(rèn)條件，如果符合，可以享受營業(yè)稅、所得稅的優(yōu)惠政策。如果不符合，按普通銷售開票。
軟硬件的成本如何核算，人工成本怎么算？
按企業(yè)成本核算方式進(jìn)行賬務(wù)處理，可以增加設(shè)置一些有自身特點(diǎn)的明細(xì)科目。如生產(chǎn)成本，下面設(shè)置原材料（硬件成本）、工資（人工費(fèi)）、專利費(fèi)（軟件成本）等等

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看委托雙方怎么約定的，最好以
合同形式
簽訂下來，約定不成的，權(quán)利最終為開發(fā)者。

雙方的口頭約定也沒有效力，一定要是在開發(fā)前簽訂合同，明確歸屬權(quán)是誰的。

我國《專利法》規(guī)定了專利權(quán)的合理使用里面有一條，就是為了開發(fā)和研究新的技術(shù)而使用，是可以使用別人的專利的，如果用途僅用于研究當(dāng)然不用支付專利使用費(fèi)。但是開發(fā)后，用于商業(yè)盈利等等，就必須正對該專利權(quán)人的同意，支付一定的使用費(fèi)，如果對方不正當(dāng)理由而不同意，而你的新的專利（你的新的發(fā)明可以申請專利的話）的實(shí)施又是建立在實(shí)施對方專利的基礎(chǔ)上時(shí)，可以申請專利的強(qiáng)制許可，你支付合理使用費(fèi)即可。這是理論上的。
實(shí)踐上，如果對方?jīng)]有申請專利，那么法律不會保護(hù)其技術(shù)！你就盡管用吧。還有一種情況是，對方申請了，但是專利申請是一個(gè)漫長的過程，申請后，專利技術(shù)要公示，要審查，到最后授予專利權(quán)要話一年多的時(shí)間，這期間，如果技術(shù)被別人使用，使用者還是要支付其一定的使用費(fèi)。如果，你在對方申請之前已經(jīng)使用該技術(shù)，那么對方申請成功后，你仍讓可以無償繼續(xù)使用該技術(shù)，但是使用的規(guī)模不得超過對方申請前自己的使用規(guī)模。
最后的最后，即使你不小心侵犯了對方的專利權(quán)，你也不用太擔(dān)心，因?yàn)槲疫^專利法對于侵權(quán)的賠償采取的主要是損失補(bǔ)償?shù)馁r償原則，也就是說，你只用填補(bǔ)你造成的損失，而不會有什么懲罰性的賠償。再說，這個(gè)東西有沒有申請專利，你去專利局查查就知道了，所有申請了的專利技術(shù)都是公開公示的，如果專利局沒有，你就放心的用。

軟件不存在專利，這是著作權(quán)
著作權(quán)屬于誰，看你們的合同有沒有明確了，如果沒有明確那就扯不清

首先，單軟件系統(tǒng)不能夠申請發(fā)明專利。可以申請軟件著作權(quán)。其次，一般這種涉及到甲乙雙方合作開發(fā)的你們，在開發(fā)之前一定要簽訂軟件合作開發(fā)協(xié)議。假設(shè)你們沒有約定過，甲方搶先注冊，這就有可能會涉及到后續(xù)的法律問題。要以人民法院的判決為準(zhǔn)。并不是說甲方搶先注冊就一定會具備主動權(quán)。要看誰的證據(jù)更有力。

以知識產(chǎn)權(quán)托管工作發(fā)展的不同階段、服務(wù)對象和服務(wù)提供者的不同構(gòu)成將知識產(chǎn)權(quán)托管分為小、中、大三種類型。
1、小托管：
小托管是存在個(gè)別企業(yè)與具有一定知識產(chǎn)權(quán)綜合服務(wù)能力的中介服務(wù)機(jī)構(gòu)之間的，關(guān)于知識產(chǎn)權(quán)綜合委托管理服務(wù)的一種托管服務(wù)方式，業(yè)務(wù)主要局限于個(gè)別企業(yè)知識產(chǎn)權(quán)的獲取、管理、保護(hù)、運(yùn)用方面。
其業(yè)務(wù)包括：對知識產(chǎn)權(quán)戰(zhàn)略與發(fā)展進(jìn)行研究，提供專業(yè)方案；協(xié)助實(shí)施知識產(chǎn)權(quán)戰(zhàn)略，逐步實(shí)現(xiàn)知識產(chǎn)權(quán)資本運(yùn)營；協(xié)助企業(yè)開發(fā)自主知識產(chǎn)權(quán)，培訓(xùn)企業(yè)人員；對知識產(chǎn)權(quán)注冊的各項(xiàng)事宜提供建議及注冊，協(xié)助完成日常法律事務(wù)；完善、監(jiān)督、落實(shí)知識產(chǎn)權(quán)的各項(xiàng)管理制度；監(jiān)測及侵權(quán)預(yù)警，調(diào)整創(chuàng)新方向和內(nèi)容，對侵權(quán)及時(shí)進(jìn)行調(diào)查、取證，有效保護(hù)企業(yè)知識產(chǎn)權(quán)；幫助企業(yè)實(shí)施品牌戰(zhàn)略，培育，協(xié)助企業(yè)實(shí)現(xiàn)名牌的經(jīng)濟(jì)價(jià)值等等。
這種知識產(chǎn)權(quán)的托管服務(wù)的優(yōu)勢在于，可以直接針對服務(wù)對象的實(shí)際需求，提供貼身服務(wù)；容易使企業(yè)在普通事務(wù)性層面獲得滿足。其局限在于，受企業(yè)意識水平和服務(wù)機(jī)構(gòu)服務(wù)能力的限制，對企業(yè)的提升和引導(dǎo)有限，服務(wù)水平參差不齊，除知識產(chǎn)權(quán)以外的其他資源的整合運(yùn)用能力不足。
2、中托管：
中托管是存在于優(yōu)勢知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)機(jī)構(gòu)或服務(wù)機(jī)構(gòu)群與有一定知識產(chǎn)權(quán)工作基礎(chǔ)的重點(diǎn)企業(yè)或產(chǎn)業(yè)群中的一種綜合知識產(chǎn)權(quán)委托服務(wù)關(guān)系。
主要適用于穩(wěn)步提升服務(wù)對象的知識產(chǎn)權(quán)管理能力，提升知識產(chǎn)權(quán)在企業(yè)發(fā)展中的重要地位，幫助企業(yè)往知識產(chǎn)權(quán)高端運(yùn)用層面扎實(shí)過渡。
3、大托管：
大托管是存在于知識產(chǎn)權(quán)托管服務(wù)聯(lián)盟與產(chǎn)業(yè)集群、區(qū)域重點(diǎn)產(chǎn)業(yè)之間的高端知識產(chǎn)權(quán)委托服務(wù)關(guān)系。
具體來講是由政府牽頭，綜合集群政府資源、園區(qū)孵化器資源、社會服務(wù)資源組成知識產(chǎn)權(quán)托管聯(lián)盟，面向國家層面或地區(qū)重點(diǎn)產(chǎn)業(yè)集群提供綜合高端知識產(chǎn)權(quán)服務(wù)，用于加速提升產(chǎn)業(yè)群體的創(chuàng)造能力，應(yīng)對全球知識產(chǎn)權(quán)風(fēng)險(xiǎn)。