股權(quán)轉(zhuǎn)讓糾紛有被告的住所地以及合同履行地法院管轄。二者沒(méi)有先后順序，但是合同中可以約定管轄的法院。根據(jù)相關(guān)法律規(guī)定，股權(quán)轉(zhuǎn)讓糾紛應(yīng)當(dāng)適用基層法院管轄。
【法律依據(jù)】
《民事訴訟法》第二十三條
因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。
第二十四條
因保險(xiǎn)合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者保險(xiǎn)標(biāo)的物所在地人民法院管轄。
第二十五條
因票據(jù)糾紛提起的訴訟，由票據(jù)支付地或者被告住所地人民法院管轄。

首先，股權(quán)轉(zhuǎn)讓糾紛屬于合同糾紛一種，由被告住所地或者合同履行地的人民法院管轄。其次，其他與公司有關(guān)的糾紛，由公司住所地人民法院管轄。
股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議糾紛管轄權(quán)確定可以按照合同糾紛的規(guī)定確定。一般由合同履行地或者被告住所地人民法院管轄。如果股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議中約定了有效的管轄協(xié)議，則根據(jù)管轄協(xié)議確定管轄法院。但雙方約定由合同簽訂地、原告住所地、標(biāo)的物所在地等與爭(zhēng)議有實(shí)際聯(lián)系的地點(diǎn)的人民法院管轄的，可以按照約定執(zhí)行。
股權(quán)轉(zhuǎn)讓糾紛的管轄，由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。如果合同沒(méi)有實(shí)際履行，當(dāng)事人雙方住所地又都不在合同約定的履行地的，應(yīng)由被告住所地人民法院管轄。同時(shí)，法律賦予當(dāng)事人協(xié)議約定管轄法院的權(quán)利，即合同的雙方當(dāng)事人可以在書(shū)面合同中協(xié)議選擇被告住所地、合同履行地；合同簽訂地、原告住所地、標(biāo)的物所在地人民法院管轄，但不得違反民訴法對(duì)級(jí)別管轄和專(zhuān)屬管轄的規(guī)定。
法律依據(jù)：《中華人民共和國(guó)民事訴訟法》
第十七條基層人民法院管轄第一審民事案件，但本法另有規(guī)定的除外。
第十八條中級(jí)人民法院管轄下列第一審民事案件：
(一)重大涉外案件
(二)在本轄區(qū)有重大影響的案件
(三)最高人民法院確定由中級(jí)人民法院管轄的案件。
第十九條高級(jí)法院管轄
高級(jí)人民法院管轄在本轄區(qū)有重大影響的第一審民事案件。
第二十條最高人民法院管轄下列第一審民事案件：
(一)在全國(guó)有重大影響的案件
(二)認(rèn)為應(yīng)當(dāng)由本院審理的案件。
第二十一條對(duì)公民提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄告住所地與經(jīng)常居住地不一致的，由經(jīng)常居住地人民法院管轄。對(duì)法人或者其他組織提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄。同一訴訟的幾個(gè)被告住所地、經(jīng)常居住地在兩個(gè)以上人民法院轄區(qū)的，各該人民法院都有管轄權(quán)。