《土地權(quán)屬爭議調(diào)查處理辦法》第二十二條在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決之前，任何一方不得改變土地利用的現(xiàn)狀。
有糾紛的土地由縣級以上人民政府確權(quán)，如果政府無法查清事實，也可能無法確權(quán)。
土地權(quán)屬爭議案件由誰負責調(diào)處？
(1)個人之間、個人與單位之間、單位與單位之間發(fā)生的爭議案件，由爭議土地所在地的縣級國土資源行政主管部門調(diào)查處理。個人之間、個人與單位之間發(fā)生的爭議案件，可以根據(jù)當事人的申請，由鄉(xiāng)級人民政府受理和處理。
(2)設區(qū)的市、自治州國土資源行政主管部門調(diào)查處理下列爭議案件：跨縣級行政區(qū)域的;同級人民政府、上級國土資源行政主管部門交辦或者有關部門轉(zhuǎn)送的。
(3)省、自治區(qū)、直轄市國土資源行政主管部門調(diào)查處理下列爭議案件：跨設區(qū)的市、自治州行政區(qū)域的;爭議一方為中央國家機關或者其直屬單位，且涉及土地面積較大的;爭議一方為軍隊，且涉及土地面積較大的;在本行政區(qū)域內(nèi)有較大影響的;同級人民政府、國土資源部交辦或者有關部門轉(zhuǎn)送的。
(4)國土資源部調(diào)查處理下列爭議案件：國務院交辦的;在全國范圍內(nèi)有重大影響的。
具體而言，應遵循以下原則：
(1)從實際出發(fā)，尊重歷史的原則
土地權(quán)屬爭議產(chǎn)生的原因很多，但多數(shù)是因歷史遺留下來的問題所引起的，這種情況在集體組織之間的土地權(quán)屬關系中十分常見。引起這類爭議的主要原因有：①歷史上鄉(xiāng)、村、社、隊、場因合并、分割、改變隸屬關系等行政建制變化遺留的權(quán)屬未定、權(quán)屬不清;②因過去的土地開發(fā)、征地退耕、興辦或停辦企事業(yè)、有組織移民形成的權(quán)屬不清;③因過去無償占用或“一平二調(diào)”造成的權(quán)屬爭議;④地界不明，包括過去無償劃撥荒山、荒地時未計算面積和劃定地界，歷史上無地界標志或地界標志不明，新劃地界不清或不合理，興修水利、平整土地、開荒、更改河道等造成地界變化等情形。這些爭議的普遍特點，就是土地占有現(xiàn)狀缺乏權(quán)屬依據(jù)或者權(quán)屬依據(jù)難以證明。處理這類糾紛，應當從歷史出發(fā)，摸清爭議土地的歷史發(fā)展變化，查明引起變化的事實背景和當時的政策依據(jù)，確定爭議產(chǎn)生的原因，以合理劃定地界、確定權(quán)屬。
(2)現(xiàn)有利益保護的原則
土地權(quán)屬爭議處理前，土地權(quán)利處于不確定狀態(tài)，因此，在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決之前，任何一方不得改變土地現(xiàn)狀，不得破壞土地上的附著物，爭議雙方應本著保護現(xiàn)有利益的原則，不得有任何破壞土地資源、阻撓爭議解決的行為。在涉及歷史原因的集體土地爭議中，如歷史事實不清、相關證據(jù)或政策依據(jù)不明，應以土地實際占有的現(xiàn)狀為根據(jù)確定土地的權(quán)屬關系。在國有土地因重復征用或重復劃撥引起的土地爭議中，也應本著“后者優(yōu)先”的原則，按土地利用現(xiàn)狀確定權(quán)利歸屬。
(3)訴訟解決以行政處理為前置的原則
政府處理在土地權(quán)屬糾紛解決方式中占有很重要的地位。土地確權(quán)是一項政策性和技術性較強的工作，政府土地行政主管部門基于對本行政區(qū)的土地狀況比較了解，對發(fā)生的爭議，能從實際出發(fā)，尊重歷史，面對現(xiàn)實，以法律、法規(guī)和土地管理規(guī)章為依據(jù)，及時、公正地解決土地權(quán)屬糾紛。因此，土地權(quán)屬爭議的解決，應先采用行政處理的方式，只有對行政處理不服，當事人才可以向人民法院起訴。當事人直接向人民法院提起訴訟的，人民法院不予受理。
村土地確權(quán)有糾紛時，政府有具體的處理流程為：
1、向縣級以上人民政府土地管理部門或者鄉(xiāng)級人民政府提出書面申請；
2、雙方當事人出示舉證的材料和依據(jù)；
3、工作人員現(xiàn)場調(diào)查材料和取證；
4、組織雙方當事人進行調(diào)解，制作書面調(diào)解書；
5、調(diào)解未達成協(xié)議的，或者調(diào)節(jié)書送達前一方或者雙方反悔的，土地管理部門及時提出處理意見，報人民政府錯處處理決定。
具體規(guī)定：《土地管理法法》第十六條土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議，由當事人協(xié)商解決；協(xié)商不成的，由人民政府處理。
單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級人民政府或者縣級以上人民政府處理。
當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內(nèi)，向人民法院起訴。
在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決前，任何一方不得改變土地利用現(xiàn)狀。

五、土地確權(quán)中應把握的幾個問題

　土地確權(quán)的目的是界定土地產(chǎn)權(quán)，明確土地權(quán)利，保障土地權(quán)利人的合法權(quán)益。土地所有權(quán)在附設在土地上的各種權(quán)利中處于最基礎的位置，土地使用權(quán)是從土地所有權(quán)上分離出來的，因此，確定一宗土地的使用權(quán)，首先要明確該宗地的所有權(quán)歸屬。
　　(一)正確劃分國家土地所有權(quán)和集體土地所有權(quán)

　　在確定土地所有權(quán)上先后存在兩個問題：一是確定土地屬于國家所有還是屬于集體所有;二是如果土地屬于集體所有，則還需確定該宗土地屬于哪一個農(nóng)民集體所有，及如何把不同農(nóng)民集體所有的土地劃分清楚。

　　1、國家土地所有權(quán)

　　(1)國家依法征收的土地，圍海、圍湖造地或者因自然力量形成的土地，確定為國家所有。

　　(2)下列土地可以確定為國家所有：

　　①依據(jù)一九五○年《中華人民共和國土地改革法》及有關規(guī)定，當時沒有將土地所有權(quán)分配給農(nóng)民集體的土地;

　　②實施一九六二年《農(nóng)村人民公社工作條例修正草案》時未劃入農(nóng)民集體范圍內(nèi)的土地;

　　③《農(nóng)村人民公社工作條例修正草案》公布以前，全民所有制單位、城市集體所有制單位和集體所有制的華僑農(nóng)場使用的原農(nóng)民集體所有的土地，包括合作化之前的個人土地，迄今沒有退給農(nóng)民集體的;

　　④解放初期接收、沒收、征收、征購的土地。

　　2、農(nóng)民集體土地所有權(quán)

　　(1)農(nóng)民集體所有的土地，按目前該農(nóng)民集體實際使用的本集體土地所有權(quán)界線確定所有權(quán)。

　　(2)法律另有規(guī)定的除外，下列土地可以確定為農(nóng)民集體所有：

　　①土地改革時分給農(nóng)民并頒發(fā)了土地所有證的土地;

　　②實施《六十條》時確定為農(nóng)民集體所有的土地;

　　③原屬于國有或者農(nóng)民集體所有的土地，經(jīng)帶地入社和實施《六十條》時固定為生產(chǎn)隊范圍內(nèi)的土地。

　　(3)農(nóng)民集體連續(xù)使用其他農(nóng)民集體所有的土地已滿二十年的，確定為現(xiàn)使用者所有。雖滿二十年，但在二十年期滿之前所有者曾向現(xiàn)使用者或有關部門提出歸還的除外。

　　3、國有土地和集體土地所有權(quán)的劃分

　　按照城市土地國有化原則，我國城市土地都屬于國家所有。這在空間地域范圍上把城市土地的國家所有權(quán)性質(zhì)進行了明確。但是界定城市市區(qū)以外的國家所有土地和集體所有土地必須搞清楚兩個問題：

　　第一，如何確定土地是否曾經(jīng)為集體所有。這一點在確定農(nóng)民集體土地所用權(quán)上已作說明。

　　第二，如何考察曾經(jīng)被確定為集體所有的土地，其后的所有權(quán)性質(zhì)有沒有發(fā)生變化。確定一宗土地在歷曾經(jīng)屬集體所有，只是確定該宗土地所有權(quán)歸屬的第一步，還不能說明這宗土地的所有權(quán)性質(zhì)就一定是集體所有，因為長期以來，我國土地權(quán)利變動頻繁，在管理上也比較薄弱，所以必須考察該宗土地在這幾十年間是否發(fā)生改變而轉(zhuǎn)為國有。

　　根據(jù)《確定土地所有權(quán)和使用權(quán)的若干規(guī)定》，集體土地所有權(quán)的性質(zhì)發(fā)生變化，主要有以下情況：

　　(1)1962年9月《六十條》公布以前，全民所有制單位，城市集體所有制單位和集體所有制的華僑農(nóng)場使用的原農(nóng)民集體所有的土地(含合作化之前的個人土地)，迄今沒有退給農(nóng)民集體的，屬于國家所有。

　　《六十條》公布時起至1982年5月《國家建設征用土地條例》公布時止，全民所有制單位、城市集體所有制單位使用的原農(nóng)民集體所有的土地，有下列情形之一的，屬于國家所有：

　　①簽訂過土地轉(zhuǎn)移等有關協(xié)議的;

　　②經(jīng)縣級以上人民政府批準使用的;

　　③進行過一定補償或安置勞動力的;

　　④接受農(nóng)民集體饋贈的;

　　⑤已購買原集體所有的建筑物的;

　　⑥農(nóng)民集體所有制企事業(yè)單位轉(zhuǎn)為全民所有制或者城市集體所有制單位的。

　　1982年5月《國家建設征用土地條例》公布時起至1987年《土地管理法》開始施行時止，全民所有制單位、城市集體所有制單位違反規(guī)定使用的農(nóng)民集體土地，依照有關規(guī)定進行了清查處理后，仍由全民所有制單位、城市集體所有制單位使用的，確定為國家所有。

　　凡屬上述情況以外未辦理征地手續(xù)使用農(nóng)民集體土地，由縣級以上地方人民政府根據(jù)具體情況，按當時規(guī)定補辦征地手續(xù)，或者退還農(nóng)民集體。1987年《土地管理法》施行后違法占用的農(nóng)民集體土地，必須依法處理后，再確定土地所有權(quán)。

　　(2)1986年中共中央、國務院《關于加強土地管理、制止亂占耕地的通知》發(fā)布之前，全民所有制單位、城市集體所有制單位租用農(nóng)民集體所有的土地，按照有關規(guī)定處理后，能夠恢復耕種的，退還農(nóng)民集體耕種，所有權(quán)仍屬于農(nóng)民集體;已建成永久性建筑物的，由用地單位按租用時的規(guī)定，補辦手續(xù)，土地歸國家所有。凡按照有關規(guī)定處理了的，可按處理決定確定所有權(quán)和使用權(quán)。

　　(3)國家建設對農(nóng)民集體全部進行移民安置并調(diào)劑土地后，遷移農(nóng)民集體原土地轉(zhuǎn)為國家所有。但移民后原集體仍繼續(xù)使用集體土地，國家未進行征用的，其所有權(quán)不變。

　　(4)因國家建設征用土地，農(nóng)民集體建制被撤銷或其人口全部轉(zhuǎn)為非農(nóng)業(yè)戶口，其未經(jīng)征用的土地歸國家所有。繼續(xù)使用原有土地的原農(nóng)民集體及其成員享有國有土地使用權(quán)。

　　(5)全民所有制單位和城鎮(zhèn)集體所有制單位兼并農(nóng)民集體企業(yè)的，辦理有關手續(xù)后，被兼并的原農(nóng)民集體企業(yè)使用的集體所有土地轉(zhuǎn)為國家所有。鄉(xiāng)(鎮(zhèn))企業(yè)依照國家建設征用土地的審批程序和補償標準使用的非鄉(xiāng)(鎮(zhèn))村農(nóng)民集體所有的土地，轉(zhuǎn)為國家所有。

　　但必須明確一點，雖然集體土地所有權(quán)性質(zhì)可以發(fā)生變化轉(zhuǎn)為國家所有，但國家土地上所有權(quán)性質(zhì)一般是不可變更的，國有土地不得再轉(zhuǎn)變?yōu)榧w土地，這是一個不可逆轉(zhuǎn)的過程。