抵銷的效力主要表現在：
1、雙方當事人所負債務全部或者部分消滅
當雙方當事人所負債務額相同時，其互負債務消滅。當雙方所負債務額不等時，債務數額小的一方的債務消滅，債務數額大的一方的債務部分消滅，債務人對未消滅的債務部分仍負清償義務。在合意抵銷中，雙方當事人可以就抵銷的效力作出約定。
2、抵銷具有溯及效力
我國法律中沒有明確規定抵銷的溯及力。通常認為，抵銷具有溯及力，抵銷的溯及力表現為：其一，自得為抵銷時就消滅的債務，不再發生利息債務；其二，自得為抵銷時起，不再發生遲延責任；其三，得抵銷的情形發生后，就一方當事人所發生的損害賠償及違約金責任，因抵銷的溯及力而歸于消滅。
抵銷為處分債權的行為，故抵銷人應有行為能力，并需要對債權有處分權。抵銷應由抵消權人以意思表示向被動債權人為之，該抵消的通知到達被動債權人處分處發生效力（《合同法》第99條第2款中段）。該被動債權人為無行為能力人或者限制行為能力人時，自通知到達其法定代理人處時發生效力。
抵銷使雙方債權按照抵銷數額而消滅。之所以如此，是因為從自動債權方面看，不能超過自己的債權額獲得滿足；從被動債權方面看，也僅于對方的債權額時，前者僅消滅一部分債權額，殘存的債權仍然存續；后者則全部消滅。
抵銷為民事行為，而民事行為的效力原則上不溯及既往，但因當事人在雙方債權具備抵銷要件時往往認為可隨時抵消，于是常常怠于為抵銷的意思表示。所以，僅抵銷的意思表示向將來發生效力，就容易產生不公平的結果。如果令抵銷的意思表示溯及最初得為抵銷時發生效力，即相互間的債權溯及得為抵銷時按照抵銷數額而消滅，結果就比較公平。所以，應當確立這樣的規則，抵銷使雙方債權溯及得為抵銷時消滅。所謂得為抵銷時，是指抵銷權發生之時。如果雙方債權的抵消權發生之時不同，則應以抵銷人的抵銷權發生時為標準。被抵銷人嗣后縱為抵銷的意思表示，，也不得溯及其抵銷權發生時產生抵消效力。因為其抵銷權已依對方的抵銷意思表示歸于消滅。至于溯及力的內容，包括雙方債權的擔保及其他從權利，均從得為抵銷時消滅；雙方債券的利息債權，均從得為抵銷時消滅；給付延遲、受領延遲、違約金、損害賠償等，均從得為抵銷時消滅。