勞動合同法明確規定，用人單位不得扣押勞動者的居民身份證和其他證件。然而，你所在的公司可能要求你提供畢業證、專業資格證書原件以供保管，這種做法背后可能涉及國家對某些特殊行業的監管。為了確保專業人員具備相應的從業資格，國家每年都會進行年檢審核，其中專業技術人員的相關證件成為重點檢查項目。公司按國家規定需確認其內部有多少專業技術人員，并檢查這些人員的學歷、職稱及崗位職業技能證書等材料，以確保符合國家要求。
因此，公司要求你提供相關證件可能與上述監管要求有關。然而，如果公司扣押你的證件，這將違反勞動合同法。建議你與公司進行溝通，明確其具體需求，并尋求妥善解決辦法。例如，雙方可以約定證件存放的期限和方式，確保你的權益得到保障。
同時，你還可以咨詢法律專業人士，了解你所在行業的具體規定及公司行為的合法性。這將有助于你在確保個人權益的前提下，順利完成工作。
如果公司確實有合理理由需要保留你的證件復印件，你可以要求公司出具正式文件，明確證件用途及保管期限，確保雙方權益得到保障。
總之，面對公司要求提供證件原件的情況，建議你保持冷靜，與公司進行充分溝通，確保自己的權益不受損害。