可以簽免責協議書，但是需要符合相關規定。自身有疾病，可以將病歷等資料留存，讓對方簽字確認，但是并不能以此免除公司的其他責任，比如繳納社保責任。與有病史的員工簽訂勞動合同時，用人單位約定的免責條款不能免除用人單位的所有責任，排除勞動者的利益，這種免責條款無效。
法律分析
協議免責要想具備法律效力除了符合責任范圍的限定外，還要滿足以下條件：協議的雙方對協議的內容有處分的權利。是雙方當事人意思自治的結果。采用欺詐、脅迫、乘人之危的手段達成的協議是無效或者可撤銷的。協議的內容不違反法律、行政法規的強制性規定，不侵害社會公益和第三人的利益。對一方顯失公平的協議也是可撤銷的。協議免責采用的形式。協議免責既可以采用書面形式也可以采用口頭形式，既可以明示做出也可以默示做出。但是采用書面形式有利于從法律上證明協議免責的效力。依法成立的事業單位，包括文化、教育、衛生、科研等各種單位，如學校、醫院、出版社等。其在國家法律規定的權限范圍內有權使用勞動者。依法成立的國家機關：在法律規定的權限范圍內，有權使用勞動者。依法成立的社會團體：包括工會、婦聯、研究會、協會等社會團體組織。依法成立的社會團體在法律規定的權限范圍內，有權使用勞動者。
法律依據
《中華人民共和國民法典》 第四百九十七條 有下列情形之一的，該格式條款無效：（一）具有本法第一編第六章第三節和本法第五百零六條規定的無效情形；（二）提供格式條款一方不合理地免除或者減輕其責任、加重對方責任、限制對方主要權利；（三）提供格式條款一方排除對方主要權利。