刑事申訴案件辦理流程為：
1、刑事申訴的立案，是指司法機關接受申訴權人申訴的法定訴訟形式。申訴權人提出申訴時，人民法院或人民檢察院對屬于本院管轄的，都應采取文書形式立案；
2、刑事申訴的審查，人民法院或人民檢察院接受申訴后應進行全面審查，不應受申訴人提出的申訴理由的限制。審查的內容應包括
案件事實和適用法律是否正確；
3、審查結果的處理，原終審人民法院對刑事申訴進行審查后，認為原判決、裁定正確的，則說服、教育申訴人，使其服判息訴；對堅持無理申訴的，可以用書面通知駁回。并告之申訴人不能再行申訴。
【法律依據】
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第二百五十三條 【因申訴而重新審判的情形】當事人及其法定代理人、近親屬的申訴符合下列情形之一的，人民法院應當重新審判：
（一）有新的證據證明原判決、裁定認定的事實確有錯誤，可能影響定罪量刑的；
（二）據以定罪量刑的證據不確實、不充分、依法應當予以排除，或者證明案件事實的主要證據之間存在矛盾的；
（三）原判決、裁定適用法律確有錯誤的；
（四）違反法律規定的訴訟程序，可能影響公正審判的；
（五）審判人員在審理該案件的時候，有貪污受賄，徇私舞弊，枉法裁判行為的。第二百五十五條 【指令再審的法院】上級人民法院指令下級人民法院再審的，應當指令原審人民法院以外的下級人民法院審理；由原審人民法院審理更為適宜的，也可以指令原審人民法院審理。第二百五十六條 【重新審判的程序】人民法院按照審判監督程序重新審判的案件，由原審人民法院審理的，應當另行組成合議庭進行。如果原來是第一審案件，應當依照第一審程序進行審判，所作的判決、裁定，可以上訴、抗訴；如果原來是第二審案件，或者是上級人民法院提審的案件，應當依照第二審程序進行審判，所作的判決、裁定，是終審的判決、裁定。
人民法院開庭審理的再審案件，同級人民檢察院應當派員出席法庭。

刑事案件申訴流程：1、對刑事申訴的立案。2、對刑事申訴的審查。3、對審查結果的處理。
【法律分析】
申訴是公民的一項基本權利。當事人及其法定代理人、近親屬，對已經發生法律效力的判決、裁定，可以向人民法院或者人民檢察院提出申訴，但是不能停止判決、裁定的執行。刑事案件申訴流程：1、刑事申訴的立案。刑事申訴的立案，是指司法機關接受申訴權人申訴的法定訴訟形式。根據相關規定：“人民法院收到申訴后，均應登記，認真審閱。原審人民法院審查、處理刑事申訴，均應立卷。”這就說明，申訴權人提出申訴時，人民法院或人民檢察院對屬于本院管轄的，都應采取文書形式立案。至于申訴立案得具備什么條件的問題，不應過于苛求。只要初步確認申訴人具備申訴主體資格。在法定期限內，具狀提出一定理由。管轄法院或人民檢察院即應予以立案審查。2、刑事申訴的審查。人民法院或人民檢察院接受申訴后應進行全面審查，不應受申訴人提出的申訴理由的限制。審查的內容應包括：(1)案件事實。弄清案件事實是審查申訴的首要任務。審查時，應調出原審案卷進行審查，對申訴人提出的申訴理由、提供的證據進行分析研究，并與案卷認定的事實相對照，以確定原判決認定的事實是否清楚、明確，證據是否確實、充分。如果發現了新事實，則要查明是否有充分的證據為根據。(2)適用法律是否正確。這是審查申訴的法律方面的重要內容。所謂適用法律，是指應以判處當時有效的法律為依據。一般不能依據新法律翻過去的老案。只有為糾正過去錯誤的法律而制定的相應的新法律，才能作為申訴審查和再審審理的依據。3、審查結果的處理。原終審人民法院對刑事申訴進行審查后，認為原判決、裁定正確的，則說服、教育申訴人，使其服判息訴；對堅持無理申訴的，可以用書面通知駁回。并告知申訴人不能再行申訴。審查后，如果發現原判確有錯誤需要重新審判的，應按審判監督程序另行組成合議庭進行再審。經再審后的案件。對再審改判無罪或免予刑事處分的當事人的善后工作，原來有工作的，由原審人民法院移交原單位或其上級主管部門負責落實；原來沒有工作的，移交當地人民政府有關部門負責處理。善后處理工作，是黨和國家取信于民，樹立法律威信，產生良好社會影響的一項重要工作，必須認真做好。刑事案件申訴應提交材料：1、申訴狀，應當載明當事人的基本情況、申訴的請求、申訴的事實與理由；2、原生效刑事判決書、裁定書，經過人民法院復查或再審的，應當附有駁回通知書、再審判決書或裁定書；3、以有新的證據證明原裁判認定的事實確有錯誤為由申訴的，應當同時附有證據目錄、證人名單和主要證據復印件或者照片。
【法律依據】
《中華人民共和國刑事訴訟法》第二百五十二條 當事人及其法定代理人、近親屬，對已經發生法律效力的判決、裁定，可以向人民法院或者人民檢察院提出申訴，但是不能停止判決、裁定的執行。

刑事案件申訴程序具體規定如下：
當事人及其法定代理人、近親屬有權提出申訴。提出申訴時，申訴人需要提交相關材料給審查法院。申訴將由終審人民法院進行審查處理。若申訴被駁回，申訴人有權向上一級人民法院進行申訴。
法律依據為《中華人民共和國刑事訴訟法》第一百一十七條。該條文明確指出，當事人和辯護人、訴訟代理人、利害關系人對于司法機關及其工作人員有以下行為之一的，有權向該機關進行申訴或控告：
（一）采取強制措施法定期限屆滿后，仍不予以釋放、解除或變更的；
（二）應當退還取保候審保證金而不退還的；
（三）對與案件無關的財物采取查封、扣押、凍結措施的；
（四）應當解除查封、扣押、凍結而未解除的。