進行刑事案件訴訟的程序如下：
1.立案指公安機關、人民檢察院、人民法院對報案、控告、舉報和犯罪人的自首等方面的材料進行審查；
2.偵查；
3.起訴有兩種，包括公訴和自訴；
4.審判；
5.執行則指刑事執行機關為了實施已經發生法律效力的判決和裁定所確定的內容而進行的活動。

根據《刑事訴訟法》規定，公訴案件的刑事訴訟程序是：
1、立案。社會上出現了涉嫌犯罪的事件，偵查機關可能是基于有關單位或個人報案、控告、舉報以及犯罪嫌疑人自首等原因而介入；
進行初步的調查后，如果認為這一事件中存在犯罪事實并應該對犯罪人追究刑事責任，則予以立案，從而啟動了刑事訴訟程序。
2、偵查。偵查機關立案以后，開始進行偵查。偵查的目的有兩個，一是找到犯罪人，一是收集能夠證明案件事實的證據。
3、審查起訴。檢察院接到偵查機關移送的案件以后，案件進入到審查起訴階段。
在這一階段，檢察院會對《起訴意見書》以及全部案卷材料和證據進行全面審查，訊問犯罪嫌疑人；
聽取被害人的意見，聽取犯罪嫌疑人、被害人委托人的意見，調查核實其他證據，對于依法應當追究犯罪嫌疑人刑事責任的，向人民法院起訴。
3、審判階段。法院在收到并審查檢察院移送起訴的案件后，除涉及國家秘密或個人隱私的案件，一般會公開開庭審理。
法庭審理后，根據已經查明的事實、證據和有關的法律規定，作出判決。
4、執行。執行則指刑事執行機關為了實施已經發生法律效力的判決和裁定所確定的內容而進行的活動；
在我國，刑事執行的主體主要是人民法院、公安機關和監獄等。

刑事訴訟法的五大程序分別是：

立案：就像是給案件“開門”一樣，如果發現有犯罪事實，并且覺得得追究犯罪人的責任，那就先立個案，刑事訴訟的大門就這么敞開了。
偵查：這一步就像是“找線索、拼拼圖”，得找到犯罪的人是誰，還得搜集證據，證明案件的事實。
審查起訴：這時候案件就到了檢察院手里，檢察院就像是“把關人”，得好好審查偵查機關送來的案件，看看能不能起訴。
審判階段：案件到了法院，就像是“開庭大戲”要上演了。法院會公開審理，法官就是這場戲的“導演”，來判定案件。
執行：判決之后，就是“執行時間”啦。這時候，人民法院、公安機關、監獄等就像“執行者”，來確保判決得到落實。

以上就是刑事訴訟法的五大程序啦，每個環節都像是刑事訴訟這部“大戲”里的重要章節，一環扣一環，共同保證著法律的公正和權威。

依據刑事訴訟法的規定，刑事案件司法程序包括案件的管轄、立案、偵查、提起訴訟、法院審理、執行法院判決等。
首先，公安機關會視情況對其進行刑事拘留，三日提請檢察院批捕，可以延長一至四日，檢察院一般會在七日內決定是否批準逮捕，如果是流竄作案、結伙作案或多次作案的重大嫌疑分子，提請批捕的時候可以延長至一個月，也就是說刑事拘留一般是十多天，最長是三十七天。
逮捕后的偵查期限一般不得超過二個月，案情復雜的案件，可以經上一級人民檢察院批準延長一個月。如果是交通不便地區、重大的犯罪集團案件、流竄作案等可經省級檢察院批準再延長二個月。對于可能判十年以下刑罰的嫌疑人，經省級檢察院批準再延長二個月。也就是說，在公安階段的時間一般是二個半月到三個月左右，最長是八個月。然后，案件由公安機關的辦案人員寫出起訴意見書及案卷、證據移送到檢察院，即審查起訴階段。這個階段一般是一個月，重大復雜的可延長半個月。檢察院審查后認可需要補充偵查的，可以退回公安機關補充偵查，也可以自行偵查。補充偵查應當在一個月內補充偵查完畢，補充以兩次為限。補充偵查后，檢察院重新計算審查起訴的期限。檢察院的公訴科審查完成后，寫出公訴書，向對應的法院提起公訴。即：一般是一個月至一個半月，最長會達到五個月。最后是到法院。審理是二審終審制，一審是在法院受理后一個月內開庭審判并宣判，至遲不得超過一個半月。如果是邊遠地區案件、重大犯罪集團、流竄作案的可以再延長一個月。如果被告人、附帶民事訴訟的當事人不服一審判決可以上訴；如果檢察院認為一審判決確有錯誤的，也可向上一級法院提出抗訴，案件進入二審程序。二審的審判時限跟一審的審限是一樣的，也是一個月，不超過一個半月，如果是邊遠地區案件、重大犯罪集團、流竄作案的可以再延長一個月。也就是說：如果沒有上訴、抗訴，一般是一個月至一個半月，最長是二個半月如果有二審，一般是二至三個月，最長五個月。如果有法院認為證據不足退回檢察院的情況，時間還會延長。綜上所述，一個刑事案件，如果不復雜，案情簡單，會在五至六個月審理結束，如果復雜，又多次退回，那審限最長會在二年左右。
刑事訴訟有管轄異議嗎
刑事訴訟中沒有管轄權異議的規定，管轄權有爭議，也是法院之間的問題，被告人是無權提出管轄權異議的。
法律規定：《最高人民法院關于適用的解釋》
第十六條?有管轄權的人民法院因案件涉及本院院長需要回避等原因，不宜行使管轄權的，可以請求移送上一級人民法院管轄。上一級人民法院可以管轄，也可以指定與提出請求的人民法院同級的其他人民法院管轄。
第十七條?兩個以上同級人民法院都有管轄權的案件，由最初受理的人民法院審判。必要時，可以移送被告人主要犯罪地的人民法院審判。
管轄權發生爭議的，應當在審理期限內協商解決；協商不成的，由爭議的人民法院分別層報共同的上級人民法院指定管轄。
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【法律依據】：
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第十八條刑事案件的偵查由公安機關進行，法律另有規定的除外。
貪污賄賂犯罪，國家工作人員的瀆職犯罪，國家機關工作人員利用職權實施的非法拘禁、刑訊逼供、報復陷害、非法搜查的侵犯公民人身權利的犯罪以及侵犯公民民主權利的犯罪，由人民檢察院立案偵查。對于國家機關工作人員利用職權實施的其他重大的犯罪案件，需要由人民檢察院直接受理的時候，經省級以上人民檢察院決定，可以由人民檢察院立案偵查。
自訴案件，由人民法院直接受理。
第一百零七條?公安機關或者人民檢察院發現犯罪事實或者犯罪嫌疑人，應當按照管轄范圍，立案偵查。
第一百一十三條?公安機關對已經立案的刑事案件，應當進行偵查，收集、調取犯罪嫌疑人有罪或者無罪、罪輕或者罪重的證據材料。對現行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留，對符合逮捕條件的犯罪嫌疑人，應當依法逮捕。
第一百七十二條?人民檢察院認為犯罪嫌疑人的犯罪事實已經查清，證據確實、充分，依法應當追究刑事責任的，應當作出起訴決定，按照審判管轄的規定，向人民法院提起公訴，并將案卷材料、證據移送人民法院。