惡意透支信用卡的立案標準有：如果行為人惡意透支信用卡的數額在一萬元以上的，公安機關就應當予以立案。但如果數額為一至十萬元，在公安機關立案前已全部還清，且情節顯著輕微的，可以依法不予追責。
【【法律依據】】
《最高人民檢察院公安部關于公安機關管轄的刑事案件立案追訴標準的規定（二）》第五十四條
進行信用卡詐騙活動，涉嫌下列情形之一的，應予立案追訴：
（一）使用偽造的信用卡，或者使用以虛假的身份證明騙領的信用卡，或者使用作廢的信用卡，斗拍仔或者冒用他人信用卡，進行詐騙活動，數額在五千元以上的；
（二）惡意透支，數額在一萬元以上的。
本條規定的“惡意透支”，是指持卡人以非法占有為目的，超過規定限額或者規定期限透支，并且經發卡銀行兩次催收后超過三個月仍不歸還的。
惡意透支，數額在一萬元以上不滿十萬元的，在公安機關立案前已償還全部透支款息，情節空汪顯著輕微的，可以依法不追究刑事責任。
【溫馨提示】
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一般來說，惡意透支一萬以上，即構成犯罪。一萬以下數額太小，銀行一般不會上訴。 一、 信用卡惡意透支 構成犯罪的條件： ①發卡行兩次催收，持卡人不予理會； ②超過3個月沒有歸還所欠款項。排除沒有收到銀行催繳款項的通知或者其他形式的通知，而沒有按時還款的行為。持卡人沒有接到有關通知或者文書，而導致過了一定的期限沒有歸還的，不屬于惡意透支。 二、惡意透支的數額判定： ①數額在1萬以上不滿10萬的，根據《刑法》第一百九十六條規定的，列為數額大； ②數額在10萬以上不滿100萬的，根據《刑法》第一百九十六條規定的，列為數額巨大； ③數額在100萬元以上的，根據《刑法》第一百九十六條規定的，列為 數額特別巨大 。惡意透支的數額，不包括復利、滯納金、手續費等發卡銀行收取的費用。

《中華人民共和國刑法》第一百九十六條 有下列情形之一，進行信用卡詐騙活動，數額較大的，處五年以下有期徒刑或者拘役，并處二萬元以上二十萬元以下罰金；數額巨大或者有其他嚴重情節的，處五年以上十年以下有期徒刑，并處五萬元以上五十萬元以下罰金；數額特別巨大或者有其他特別嚴重情節的，處十年以上有期徒刑或者無期徒刑，并處五萬元以上五十萬元以下罰金或者沒收財產： （一）使用偽造的信用卡，或者使用以虛假的身份證明騙領的信用卡的； （二）使用作廢的信用卡的； （三）冒用他人信用卡的； （四）惡意透支的。 前款所稱惡意透支，是指持卡人以非法占有為目的，超過規定限額或者規定期限透支，并且經發卡銀行催收后仍不歸還的行為。