建設工程合同糾紛的管轄，既涉及地域管轄，也涉及級別管轄。
1、級別管轄
級別管轄是指不同級別人民法院受理第一審建設工程合同糾紛的權限分工。一般情況下基層人民法院管轄第一審民事案件。中級人民法院管轄以下案件：重大涉外案件、在本轄區有重大影響的案件、最高人民法院確定由中級人民法院管轄的案件。在建設工程合同糾紛中，判斷是否在本轄區有重大影響的依據主要是合同爭議的標的額。由于建設工程合同糾紛爭議的標的額往往較大，因此往往由中級人民法院受理一審訴訟，有時甚至由高級人民法院受理一審訴訟。
2、地域管轄
地域管轄是指同級人民法院在受理第一審建設工程合同糾紛的權限分工。對于一般的合同爭議，由被告住所地或合同履行地人民法院管轄。《民事訴訟法》也允許合同當事人在書面協議中選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地人民法院管轄。對于建設工程合同的糾紛一般都適用不動產所在地的專屬管轄，由工程所在地人民法院管轄。
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合同無效的管轄法院，一般是被告住所地的人民法院或者合同履行地的人民法院；如果被告住所地與經常居住地不一致的，則由被告經常居住地的人民法院管轄。
【法律依據】
《中華人民共和國民事訴訟法》第二十一條
對公民提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄；被告住所地與經常居住地不一致的，由經常居住地人民法院管轄。對法人或者其他組織提起的民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄。同一訴訟的幾個被告住所地、經常居住地在兩個以上人民法院轄區的，各該人民法院都有管轄權。
第二十三條
因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。