一、委托
1、司法鑒定機構接受司法機關、仲裁機構的司法鑒定委托。
2、在訴訟案件中，在當事人負有舉證責任的情況下，司法鑒定機構也可以接受當事人的司法鑒定委托。當事人委托司法鑒定時一般通過律師事務所進行。
二、受理
司法鑒定機構收到委托書后，應對委托人的委托事項進行審核，并作出如下決定：
1、對于符合受理條件的，能夠即時決定受理的，司法鑒定機構應當與委托人簽訂《司法鑒定委托受理合同》；
2、不能即時決定受理的，應當向委托人出具《司法鑒定委托材料收領單》，在收領委托材料之日起7日內對是否受理作出決定；
3、對于不符合受理條件的，決定不予受理的，應當退回鑒定材料并向委托人說明明理由；
4、對于函件委托的，司法鑒定機構應當在收到函件之日起7日內作出是否受理的書面答復。
三、初次鑒定
鑒定機構受理案件后，應當指派具有社會專業司法鑒定資格的人員承擔鑒定工作，同一鑒定事項應當由兩名具有社會專業司法鑒定資格的人員進行。
四、補充鑒定
司法鑒定機構接受委托進行補充鑒定，應當對委托人請求的事項進行審查，不屬《司法鑒定程序通則》第三十條規定的情形，社會專業司法鑒定機構應當向委托人說明情況，并退回委托書。
補充鑒定符合《司法鑒定程序通則》第三十一條規定的情形，社會專業司法鑒定機構可以指定原鑒定人進行，也可以指派其他社會專業司法鑒定人進行，補充鑒定文書是原鑒定文書的組成部分。有下列情形之一的，司法鑒定機構可以接受委托，進行補充鑒定：
(1)發現新的相關鑒定材料；
(2)原鑒定項目有遺漏。
五、重新鑒定
對重新鑒定，專業司法鑒定機構應當要求委托人提供與原鑒定材料相同的材料。重新鑒定仍在原社會專業司法鑒定機構進行的，不能由原鑒定人承辦重新鑒定的事項。有下列情形之一的，司法鑒定機構可以接受委托，進行重新鑒定：
(1)司法鑒定機構、司法鑒定人超越司法鑒定業務范圍或者執業類別進行鑒定的；
(2)送鑒的材料虛假或者失實的；
(3)原鑒定使用的標準、方法或者儀器設備不當，導致原鑒定結論不科學、不準確的；
(4)原鑒定結論與其他證據有矛盾的；
(5)原司法鑒定人應當回避而沒有回避的；
(6)原司法鑒定人因過錯出具錯誤鑒定結論的；
六、復核鑒定
對鑒定結論有異議需進行復核鑒定的，其他資質較高的司法鑒定機構可以接受委托，進行復核鑒定。復核鑒定除需提交鑒定材料外，還應提交原司法鑒定文書。
七、司法鑒定文書的出具
司法鑒定人完成社會專業司法鑒定工作后，應當出具司法鑒定文書。社會專業司法鑒定文書的制作應當符合《司法鑒定程序通則》第三十九條，第四十條，第四十一條，第四十二條規定的要求。司法鑒定文書正本一式三份，其中一份交委托人，兩份由司法鑒定機構存檔。

醫療過失鑒定流程：1、首次醫療事故鑒定由設區市級地方醫學會和省．自治區．直轄市直接管轄的縣（市）地方醫學會負責組織進行，從接受醫療事故鑒定之日起5天內通知醫療事故爭議雙方當事人進行醫療事故鑒定所需資料。2、當事人應當自收到醫學會通知之日起10日內提交有關醫療事故鑒定的材料．書面陳述及答辯；醫學會應當自接到雙方當事人提交的有關醫療事故技術鑒定的材料．書面陳述及答辯之日起45日內組織鑒定并出具醫療事故技術鑒定書。3、具體鑒定由專家鑒定組組長主持，鑒定開始后先由患者進行陳述意見和理由，再由醫院進行陳述，然后專家鑒定組成員根據需要對雙方進行詢問。必要時，專家還可以現場查看患者病體，進行醫學檢查；4、專家鑒定組對雙方提供的書面材料．陳述及答辯等進行討論，經過合議，根據半數以上成員的一致意見形成鑒定結論，對鑒定結論的不同意見，要注明。5、鑒定結束后，制作《醫療事故技術鑒定書》，鑒定結論包括違法違規事實、因果關系、責任程度、事故等級和對患者的醫療護理建議。另外，為保護專家和醫患雙方的利益，醫療事故鑒定過程一般不準許旁聽。6、當事人對首次醫療事故鑒定結論不服的，可以自收到首次鑒定結論之日起15日內向醫療機構所在地衛生行政部門提出再次鑒定的申請，省．自治區．直轄市地方醫學會負責組織再次鑒定工作。再次鑒定的程序同首次鑒定程序。《醫療事故處理條例》第二十條、第二十二條、第二十四條