新農合醫保報銷范圍包括：參加人員在統籌期內因病在定點醫院住院診治所產生的藥費、檢查費、化驗費、手術費、治療費、護理費等符合城鎮職工醫療保險報銷范圍的部分（即有效醫藥費用）。新農村合作醫療報銷條件如下：
1、合作醫療指定醫療機構就醫;
2、原始發票；
3、醫保卡和本人身份證。
新型農村合作醫療基金報銷支付特殊病種有：惡性腫瘤化療、放療；重癥尿毒癥的血透和腹透；組織或器官移植后的抗排異反應治療；精神分裂癥伴精神衰退；系統性紅斑狼瘡（有心、肺、腎、肝及神經系統并發癥之一者）；再生障礙性貧血；心臟手術后抗凝治療。其余可報銷的特殊病種，以當地具體政策為準。
特殊病種的特定門診治療包括治療期間必須的支持療法和全身、局部反應對癥處理，一般輔助治療不列入報銷范圍。
住院醫藥費結報程序及時限
在本市定點醫療就診入院，參加農村合作醫療需帶上本人身份證、新型農村合作醫療卡辦理住院手續。出院的時候，由所在醫院按照補償相關規定給予實時結報。
在市外以及以上的醫院發生住院醫藥費，參加農村合作醫療者出院以后將新型農村合作醫療卡、身份證、轉院轉診單、務工或探親證明和所住醫院出具的醫藥費用清單、出院小結、醫藥費發票原件等材料交鎮鄉財政所初審，由市合管辦審核結報。
補償時限：下年度1月30日之前。逾期作自動放棄，不予報銷。跨年度的醫藥費轉下年度結報。
法律依據：
《中華人民共和國社會保險法》
第二十八條 符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。
第二十九條 參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。

合作醫療，是由我國農民自己創造的互助共濟的醫療保障制度。其報銷的范圍主要有：
一、農村合作醫療門急診報銷范圍：(一)農村合作醫療門急診檢查費用：治療費、注射費、輸液費、清創縫合費、針灸火罐費、B超費、心電圖費、X線費、化驗費、一次性輸液器費、注射器等費用。（二)農村合作醫療門急診藥品《xx省新農合基本用藥目錄2008版》規定的藥品。
二、農村合作醫療住院報銷范圍：(一)農村合作醫療住院費用：住院期間的治療費、藥費、化驗費、檢查費、手術費、住院費等可報費用及特殊病種的門診可報醫療費用，醫療報銷范圍可參考本省的藥品報銷目錄。(二)農村合作醫療特殊病種費用。主要包括：治療惡性腫瘤放化療、重癥尿毒癥透析治療、組織器官移植后抗排異治療、失代償期肝硬化、再生障礙性貧血、系統性紅斑狼瘡、精神病、血友病、肺結核病、苯丙酮尿癥(10歲以內)、兒童孤獨癥(上述特殊病種等查收的費用。可直接選擇定點醫院，刷新農合的醫保卡即可報銷。