法律分析：個人所得稅專項附加扣除申報方式有兩種：一種由扣繳單位按月申報、另一種須等到年終匯算清繳時自行申報。如果您選擇申報方式為“通過扣繳義務人申報”，單位可以使用扣繳端軟件，獲取您填寫的專項附加扣除信息，按月計算應預扣預繳稅款后，向稅務機關辦理全員全額納稅申報。在這種方式下，您可以在預扣預繳期間享受扣除。如果您未能及時報送，也可在以后月份補報，由單位在當年剩余月份發放工資時補扣，不影響享受專項附加扣除。

法律依據：《中華人民共和國個人所得稅法》 第二條 下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：（一）工資、薪金所得；（二）勞務報酬所得；（三）稿酬所得；（四）特許權使用費所得；（五）經營所得；（六）利息、股息、紅利所得；（七）財產租賃所得；（八）財產轉讓所得；（九）偶然所得。居民個人取得前款第一項至第四項所得（以下稱綜合所得），按納稅年度合并計算個人所得稅；非居民個人取得前款第一項至第四項所得，按月或者按次分項計算個人所得稅。納稅人取得前款第五項至第九項所得，依照本法規定分別計算個人所得稅。

法律分析：個稅申報有兩種方式，一種是通過扣繳義務人申報，另一種是綜合所得年度自行申報。其中，通過扣繳義務人申報就是在扣繳單位辦理扣除。員工可以填寫好紙質表格后，提交給財務或人力資源部門，也可以在APP上填寫好相關信息之后直接推送給扣繳單位。綜合所得年度自行申報就是個人直接向稅務機關申報。可以下載APP或者登陸網站完成注冊，然后按照系統提示操作填寫，報送。如果有任職單位的，可以選第一種，單位每月進行申報。如果是個體戶類型的，可以選第二種。不管選擇哪一種報送方式，數據在兩端都可以看到 ,單位也可以下載個人填寫的專項附加扣除信息進行稅前扣除，如果兩者出現信息不對等的情況，那么還是以個人提交的為主。

法律依據：《中華人民共和國個人所得稅法》 第二條 下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：

　　（一）工資、薪金所得；

　　（二）勞務報酬所得；

　　（三）稿酬所得；

　　（四）特許權使用費所得；

　　（五）經營所得；

　　（六）利息、股息、紅利所得；

　　（七）財產租賃所得；

　　（八）財產轉讓所得；

　　（九）偶然所得。

　　居民個人取得前款第一項至第四項所得（以下稱綜合所得），按納稅年度合并計算個人所得稅；非居民個人取得前款第一項至第四項所得，按月或者按次分項計算個人所得稅。納稅人取得前款第五項至第九項所得，依照本法規定分別計算個人所得稅。

法律分析：1、通過扣繳義務人申報：這種指的是向單位申報個人信息，每個月稅務機關會把專項附加扣除相關信息全量推送至單位，單位可以從代扣繳軟件獲取員工已經報送的專項附加扣除信息，并從中計算出員工應預扣預繳的稅款，再向稅務機關辦理全員全額納稅申報。最后從工資中減去應繳的稅款，剩下的就是你的到手工資了。2、綜合所得年度自行申報：這種指的是直接向稅務機關申報，即每個月單位發放工資時正常扣稅，然后由納稅人自己在第二年去稅務機關辦理匯算清繳，并將有關信息提供給稅務機關，讓稅務部門其辦理退稅。個人所得稅扣除申報方式選哪個主要還是看你個人意愿吧，希財君建議如果是單位職工的話最好選擇第一種申報方式，就不用再請假去稅務部門辦理退稅了。而若是自由職業者或者個體戶的話，可以選擇第二種申報方式。

法律依據：《中華人民共和國個人所得稅法》第十一條　居民個人取得綜合所得，按年計算個人所得稅；有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次預扣預繳稅款；需要辦理匯算清繳的，應當在取得所得的次年三月一日至六月三十日內辦理匯算清繳。預扣預繳辦法由國務院稅務主管部門制定。居民個人向扣繳義務人提供專項附加扣除信息的，扣繳義務人按月預扣預繳稅款時應當按照規定予以扣除，不得拒絕。非居民個人取得工資、薪金所得，勞務報酬所得，稿酬所得和特許權使用費所得，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳稅款，不辦理匯算清繳。